Protein–RNA interactions for Protein: H3BNH8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNH8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H3BNH8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H3BNH8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H3BNH8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H3BNH8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H3BNH8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H3BNH8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H3BNH8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H3BNH8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H3BNH8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H3BNH8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H3BNH8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H3BNH8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H3BNH8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
H3BNH8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H3BNH8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H3BNH8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H3BNH8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H3BNH8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H3BNH8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H3BNH8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H3BNH8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H3BNH8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H3BNH8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H3BNH8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H3BNH8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H3BNH8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H3BNH8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H3BNH8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H3BNH8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H3BNH8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H3BNH8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H3BNH8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H3BNH8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H3BNH8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H3BNH8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H3BNH8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H3BNH8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
H3BNH8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H3BNH8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H3BNH8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H3BNH8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H3BNH8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H3BNH8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H3BNH8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
H3BNH8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H3BNH8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H3BNH8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H3BNH8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H3BNH8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H3BNH8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H3BNH8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H3BNH8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H3BNH8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H3BNH8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H3BNH8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H3BNH8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H3BNH8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H3BNH8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
H3BNH8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
H3BNH8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H3BNH8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H3BNH8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H3BNH8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H3BNH8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H3BNH8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H3BNH8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H3BNH8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H3BNH8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H3BNH8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H3BNH8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H3BNH8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
H3BNH8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H3BNH8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H3BNH8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H3BNH8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H3BNH8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H3BNH8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H3BNH8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H3BNH8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H3BNH8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H3BNH8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
H3BNH8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3BNH8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3BNH8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3BNH8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3BNH8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3BNH8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3BNH8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3BNH8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3BNH8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3BNH8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3BNH8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3BNH8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3BNH8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3BNH8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3BNH8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3BNH8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3BNH8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H3BNH8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms