Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HMGB1P1B2RPK0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HMGB1P1B2RPK0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms