Protein–RNA interactions for Protein: A6XGL0

YJEFN3, YjeF N-terminal domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YJEFN3A6XGL0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YJEFN3A6XGL0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YJEFN3A6XGL0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms