Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC85CA6NKD9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC85CA6NKD9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms