Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM247A6NEH6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM247A6NEH6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM247A6NEH6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM247A6NEH6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM247A6NEH6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM247A6NEH6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM247A6NEH6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM247A6NEH6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM247A6NEH6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM247A6NEH6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM247A6NEH6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM247A6NEH6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM247A6NEH6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM247A6NEH6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM247A6NEH6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM247A6NEH6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM247A6NEH6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM247A6NEH6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM247A6NEH6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM247A6NEH6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM247A6NEH6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM247A6NEH6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM247A6NEH6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM247A6NEH6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM247A6NEH6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM247A6NEH6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM247A6NEH6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM247A6NEH6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM247A6NEH6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM247A6NEH6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM247A6NEH6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM247A6NEH6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM247A6NEH6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM247A6NEH6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM247A6NEH6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM247A6NEH6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM247A6NEH6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM247A6NEH6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM247A6NEH6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM247A6NEH6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM247A6NEH6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM247A6NEH6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM247A6NEH6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM247A6NEH6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM247A6NEH6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM247A6NEH6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM247A6NEH6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM247A6NEH6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM247A6NEH6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM247A6NEH6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM247A6NEH6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM247A6NEH6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM247A6NEH6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMEM247A6NEH6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM247A6NEH6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms