Protein–RNA interactions for Protein: A6NED2

RCCD1, RCC1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1A6NED2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RCCD1A6NED2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RCCD1A6NED2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms