Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VWA3AA6NCI4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VWA3AA6NCI4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms