Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL33A6NCF5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL33A6NCF5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms