Protein–RNA interactions for Protein: A4D126

ISPD, D-ribitol-5-phosphate cytidylyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISPDA4D126 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ISPDA4D126 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ISPDA4D126 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ISPDA4D126 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ISPDA4D126 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ISPDA4D126 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms