Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVQ0

SPAAR, Small regulatory polypeptide of amino acid response, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAARA0A1B0GVQ0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SPAARA0A1B0GVQ0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SPAARA0A1B0GVQ0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPAARA0A1B0GVQ0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPAARA0A1B0GVQ0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPAARA0A1B0GVQ0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPAARA0A1B0GVQ0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPAARA0A1B0GVQ0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPAARA0A1B0GVQ0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPAARA0A1B0GVQ0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPAARA0A1B0GVQ0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SPAARA0A1B0GVQ0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPAARA0A1B0GVQ0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPAARA0A1B0GVQ0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPAARA0A1B0GVQ0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms