Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 APBA2-202ENST00000411764 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 CACNA1C-213ENST00000399629 6562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 KCNQ3-201ENST00000388996 11510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 PHC2-203ENST00000373422 2799 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 SIDT2-220ENST00000628876 2609 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 TMPRSS13-205ENST00000526090 2592 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 AC092145.1-201ENST00000564809 2434 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 EDAR-203ENST00000409271 4323 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 PRKAR1A-217ENST00000589228 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 APLF-201ENST00000303795 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 SLC45A4-201ENST00000024061 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 AC005837.1-201ENST00000565271 1717 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 AC008575.2-202ENST00000506997 1643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 CHODL-207ENST00000543733 1637 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 KIR3DL1-202ENST00000358178 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 WDR1-204ENST00000499869 3054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 CSMD2-202ENST00000338325 1544 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 PRAMEF36P-202ENST00000448180 1452 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 CES2-202ENST00000417689 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 FXYD5-203ENST00000392218 763 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 PGAM1P2-201ENST00000436071 725 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 IGHV4-31-201ENST00000438142 428 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 RPSAP11-201ENST00000443010 881 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 AP001271.1-201ENST00000445532 206 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 AL365357.1-201ENST00000455621 357 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 GIMD1-201ENST00000507153 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 AC051619.1-201ENST00000560007 616 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 AL121578.3-201ENST00000567273 710 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 AC110285.1-201ENST00000572077 665 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 LINC02074-201ENST00000581028 569 ntTSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 LINC02074-202ENST00000584003 573 ntTSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 AC067969.2-201ENST00000597015 570 ntTSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 NCF4-AS1-202ENST00000619915 995 ntTSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 FAM25BP-201ENST00000623997 268 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 FRMPD1-202ENST00000377765 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 SPART-203ENST00000451493 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 TUBB8-204ENST00000564130 2438 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 ELP2-204ENST00000423854 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 TPT1-212ENST00000530705 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 SH3BGRL2-201ENST00000369838 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 DIRAS1-201ENST00000323469 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 IP6K2-210ENST00000431721 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 TMEM170A-201ENST00000357613 4959 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 JADE1-201ENST00000226319 5772 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 SLC38A11-201ENST00000303735 3737 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 PRAMEF8-201ENST00000357367 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 ACCSL-201ENST00000378832 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 GAB4-201ENST00000400588 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 RALGAPB-201ENST00000262879 8663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 CYB5B-204ENST00000515314 1658 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 KCNAB2-204ENST00000378083 4142 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 NCR1-205ENST00000594765 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 AC093627.7-201ENST00000567533 3208 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 CTNNA2-219ENST00000629316 3167 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 ZNF189-203ENST00000374861 3134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 FN1-202ENST00000336916 8435 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 AR-208ENST00000612452 10676 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 EPHB4-202ENST00000360620 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 FOXP4-201ENST00000307972 3745 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 DOCK10-201ENST00000258390 7260 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 C5orf66-AS2-201ENST00000505663 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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PTPRJQ12913 RCVRN-201ENST00000226193 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 MEOX1-201ENST00000318579 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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PTPRJQ12913 TRAFD1-202ENST00000412615 2697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 SLC45A3-201ENST00000367145 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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PTPRJQ12913 LINC00619-201ENST00000374432 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 LDHAL6FP-201ENST00000405916 1082 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 POLR2H-202ENST00000429568 878 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 AC092447.4-201ENST00000436042 673 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 SOX5-204ENST00000441133 638 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 CHCHD3P3-201ENST00000446783 640 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 AC108472.1-201ENST00000447277 618 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 CMTM1-206ENST00000457188 765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 AC079942.1-201ENST00000505557 384 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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PTPRJQ12913 CMTM1-215ENST00000531885 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 LINC01405-203ENST00000548368 705 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 AC025265.1-202ENST00000550029 738 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 AC025284.1-201ENST00000564358 579 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 ZNF563-203ENST00000595977 958 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 Metazoa_SRP.56-201ENST00000612077 279 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 ETS2-202ENST00000360938 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 BOLL-202ENST00000321801 3135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 DDR1-223ENST00000324771 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 DLAT-202ENST00000393051 3517 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 CHID1-204ENST00000449825 3537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 FBN3-201ENST00000270509 9232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 WIPF1-204ENST00000392547 4587 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 AC022113.1-201ENST00000499131 1674 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PTPRJQ12913 ACSM5-201ENST00000331849 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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