Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRP12Q9Y561 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRP12Q9Y561 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms