Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
ATG4BQ9Y4P1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG4BQ9Y4P1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms