Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
TMED5Q9Y3A6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED5Q9Y3A6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED5Q9Y3A6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED5Q9Y3A6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED5Q9Y3A6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED5Q9Y3A6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED5Q9Y3A6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED5Q9Y3A6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED5Q9Y3A6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED5Q9Y3A6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED5Q9Y3A6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED5Q9Y3A6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED5Q9Y3A6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED5Q9Y3A6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED5Q9Y3A6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED5Q9Y3A6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED5Q9Y3A6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED5Q9Y3A6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED5Q9Y3A6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED5Q9Y3A6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED5Q9Y3A6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED5Q9Y3A6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED5Q9Y3A6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED5Q9Y3A6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED5Q9Y3A6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED5Q9Y3A6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED5Q9Y3A6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED5Q9Y3A6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED5Q9Y3A6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED5Q9Y3A6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED5Q9Y3A6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED5Q9Y3A6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED5Q9Y3A6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED5Q9Y3A6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED5Q9Y3A6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED5Q9Y3A6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED5Q9Y3A6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED5Q9Y3A6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED5Q9Y3A6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED5Q9Y3A6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED5Q9Y3A6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED5Q9Y3A6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED5Q9Y3A6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED5Q9Y3A6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED5Q9Y3A6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED5Q9Y3A6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED5Q9Y3A6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED5Q9Y3A6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED5Q9Y3A6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED5Q9Y3A6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED5Q9Y3A6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED5Q9Y3A6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED5Q9Y3A6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms