Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SMC3Q9UQE7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMC3Q9UQE7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms