Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SHANK2Q9UPX8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SHANK2Q9UPX8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SHANK2Q9UPX8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SHANK2Q9UPX8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SHANK2Q9UPX8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SHANK2Q9UPX8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SHANK2Q9UPX8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SHANK2Q9UPX8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SHANK2Q9UPX8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SHANK2Q9UPX8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SHANK2Q9UPX8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SHANK2Q9UPX8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SHANK2Q9UPX8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SHANK2Q9UPX8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SHANK2Q9UPX8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SHANK2Q9UPX8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SHANK2Q9UPX8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SHANK2Q9UPX8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SHANK2Q9UPX8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SHANK2Q9UPX8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SHANK2Q9UPX8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SHANK2Q9UPX8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SHANK2Q9UPX8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SHANK2Q9UPX8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SHANK2Q9UPX8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SHANK2Q9UPX8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SHANK2Q9UPX8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SHANK2Q9UPX8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SHANK2Q9UPX8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
SHANK2Q9UPX8 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SHANK2Q9UPX8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SHANK2Q9UPX8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SHANK2Q9UPX8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SHANK2Q9UPX8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SHANK2Q9UPX8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SHANK2Q9UPX8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SHANK2Q9UPX8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SHANK2Q9UPX8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SHANK2Q9UPX8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SHANK2Q9UPX8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SHANK2Q9UPX8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SHANK2Q9UPX8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SHANK2Q9UPX8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SHANK2Q9UPX8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
SHANK2Q9UPX8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
SHANK2Q9UPX8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
SHANK2Q9UPX8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
SHANK2Q9UPX8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
SHANK2Q9UPX8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SHANK2Q9UPX8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
SHANK2Q9UPX8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SHANK2Q9UPX8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
SHANK2Q9UPX8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
SHANK2Q9UPX8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
SHANK2Q9UPX8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SHANK2Q9UPX8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
SHANK2Q9UPX8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
SHANK2Q9UPX8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
SHANK2Q9UPX8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SHANK2Q9UPX8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SHANK2Q9UPX8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SHANK2Q9UPX8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SHANK2Q9UPX8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SHANK2Q9UPX8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SHANK2Q9UPX8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SHANK2Q9UPX8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SHANK2Q9UPX8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SHANK2Q9UPX8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
SHANK2Q9UPX8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SHANK2Q9UPX8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SHANK2Q9UPX8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SHANK2Q9UPX8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SHANK2Q9UPX8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SHANK2Q9UPX8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SHANK2Q9UPX8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SHANK2Q9UPX8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SHANK2Q9UPX8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SHANK2Q9UPX8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SHANK2Q9UPX8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SHANK2Q9UPX8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SHANK2Q9UPX8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SHANK2Q9UPX8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SHANK2Q9UPX8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SHANK2Q9UPX8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SHANK2Q9UPX8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SHANK2Q9UPX8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SHANK2Q9UPX8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SHANK2Q9UPX8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SHANK2Q9UPX8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
SHANK2Q9UPX8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SHANK2Q9UPX8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SHANK2Q9UPX8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SHANK2Q9UPX8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SHANK2Q9UPX8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
SHANK2Q9UPX8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SHANK2Q9UPX8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SHANK2Q9UPX8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SHANK2Q9UPX8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SHANK2Q9UPX8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms