Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPT9

USP22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22Q9UPT9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP22Q9UPT9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP22Q9UPT9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP22Q9UPT9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP22Q9UPT9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP22Q9UPT9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP22Q9UPT9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP22Q9UPT9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP22Q9UPT9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP22Q9UPT9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP22Q9UPT9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP22Q9UPT9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP22Q9UPT9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP22Q9UPT9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP22Q9UPT9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP22Q9UPT9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP22Q9UPT9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
USP22Q9UPT9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
USP22Q9UPT9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
USP22Q9UPT9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
USP22Q9UPT9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
USP22Q9UPT9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
USP22Q9UPT9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
USP22Q9UPT9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
USP22Q9UPT9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP22Q9UPT9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP22Q9UPT9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP22Q9UPT9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP22Q9UPT9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP22Q9UPT9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP22Q9UPT9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP22Q9UPT9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP22Q9UPT9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP22Q9UPT9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP22Q9UPT9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP22Q9UPT9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms