Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM8

AP4E1, AP-4 complex subunit epsilon-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4E1Q9UPM8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AP4E1Q9UPM8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms