Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SLC12A4Q9UP95 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms