Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ6

CAPN11, Calpain-11, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN11Q9UMQ6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN11Q9UMQ6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms