Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
MKLN1Q9UL63 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms