Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSEQ9UL01 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSEQ9UL01 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSEQ9UL01 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSEQ9UL01 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSEQ9UL01 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSEQ9UL01 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSEQ9UL01 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSEQ9UL01 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSEQ9UL01 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSEQ9UL01 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSEQ9UL01 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSEQ9UL01 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSEQ9UL01 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSEQ9UL01 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DSEQ9UL01 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
DSEQ9UL01 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
DSEQ9UL01 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DSEQ9UL01 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms