Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKY7

CDV3, Protein CDV3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDV3Q9UKY7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDV3Q9UKY7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDV3Q9UKY7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDV3Q9UKY7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDV3Q9UKY7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDV3Q9UKY7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDV3Q9UKY7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDV3Q9UKY7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDV3Q9UKY7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CDV3Q9UKY7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDV3Q9UKY7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDV3Q9UKY7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDV3Q9UKY7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDV3Q9UKY7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDV3Q9UKY7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDV3Q9UKY7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDV3Q9UKY7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CDV3Q9UKY7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDV3Q9UKY7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDV3Q9UKY7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDV3Q9UKY7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDV3Q9UKY7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDV3Q9UKY7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDV3Q9UKY7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDV3Q9UKY7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CDV3Q9UKY7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDV3Q9UKY7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDV3Q9UKY7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDV3Q9UKY7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms