Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA11Q9UKX5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGA11Q9UKX5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA11Q9UKX5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms