Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HDAC9Q9UKV0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HDAC9Q9UKV0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms