Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXO4Q9UKT5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO4Q9UKT5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms