Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW3

DNMT3L, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3LQ9UJW3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNMT3LQ9UJW3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DNMT3LQ9UJW3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms