Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCP2D1Q9UJQ7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SCP2D1Q9UJQ7 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms