Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIU6

SIX4, Homeobox protein SIX4, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX4Q9UIU6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SIX4Q9UIU6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms