Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MBD1Q9UIS9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms