Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
CTNNA3Q9UI47 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTNNA3Q9UI47 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms