Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL0

DDX25, ATP-dependent RNA helicase DDX25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX25Q9UHL0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DDX25Q9UHL0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX25Q9UHL0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms