Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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SS18L2Q9UHA2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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SS18L2Q9UHA2 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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SS18L2Q9UHA2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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SS18L2Q9UHA2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SS18L2Q9UHA2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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