Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBXO40Q9UH90 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms