Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOBEC3BQ9UH17 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC3BQ9UH17 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms