Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLKQ9UBT6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLKQ9UBT6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms