Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARHGAP28Q9P2N2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGAP28Q9P2N2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms