Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL9Q9P2J3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL9Q9P2J3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms