Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCDH10Q9P2E7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCDH10Q9P2E7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms