Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTTNBP2NLQ9P2B4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTTNBP2NLQ9P2B4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms