Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCHIP1Q9P0W5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SCHIP1Q9P0W5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms