Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNIP1Q9NZI2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNIP1Q9NZI2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms