Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZD8

SPG21, Maspardin, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG21Q9NZD8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPG21Q9NZD8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPG21Q9NZD8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms