Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRN3Q9NYV6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms