Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NKIRAS1Q9NYS0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKIRAS1Q9NYS0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKIRAS1Q9NYS0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKIRAS1Q9NYS0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKIRAS1Q9NYS0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKIRAS1Q9NYS0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKIRAS1Q9NYS0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKIRAS1Q9NYS0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKIRAS1Q9NYS0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKIRAS1Q9NYS0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKIRAS1Q9NYS0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKIRAS1Q9NYS0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms