Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RDH8Q9NYR8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RDH8Q9NYR8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms