Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM53CQ9NYF3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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