Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYB5

SLCO1C1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1C1Q9NYB5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLCO1C1Q9NYB5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLCO1C1Q9NYB5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLCO1C1Q9NYB5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLCO1C1Q9NYB5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLCO1C1Q9NYB5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLCO1C1Q9NYB5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLCO1C1Q9NYB5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLCO1C1Q9NYB5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLCO1C1Q9NYB5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLCO1C1Q9NYB5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLCO1C1Q9NYB5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLCO1C1Q9NYB5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLCO1C1Q9NYB5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLCO1C1Q9NYB5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLCO1C1Q9NYB5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLCO1C1Q9NYB5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLCO1C1Q9NYB5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLCO1C1Q9NYB5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SLCO1C1Q9NYB5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLCO1C1Q9NYB5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLCO1C1Q9NYB5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLCO1C1Q9NYB5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLCO1C1Q9NYB5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLCO1C1Q9NYB5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLCO1C1Q9NYB5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLCO1C1Q9NYB5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLCO1C1Q9NYB5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLCO1C1Q9NYB5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLCO1C1Q9NYB5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLCO1C1Q9NYB5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SLCO1C1Q9NYB5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLCO1C1Q9NYB5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLCO1C1Q9NYB5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLCO1C1Q9NYB5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLCO1C1Q9NYB5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLCO1C1Q9NYB5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLCO1C1Q9NYB5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLCO1C1Q9NYB5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLCO1C1Q9NYB5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLCO1C1Q9NYB5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLCO1C1Q9NYB5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLCO1C1Q9NYB5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SLCO1C1Q9NYB5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms