Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY43

BARHL2, BarH-like 2 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL2Q9NY43 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BARHL2Q9NY43 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BARHL2Q9NY43 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms