Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ERVK13-1Q9NX77 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK13-1Q9NX77 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms